Interacciones intermoleculares de la proteína de membrana Arf*GTP con potasio y glicerol, componentes mayoritarios de la vinaza de caña de azúcar
La vinaza de caña de azúcar, al ser un residuo producido en altas cantidades derivado de los procesos industriales para la producción de Etanol, es una mezcla de compuestos que tiene una utilidad cíclica para matrices de suelos debido a su composición natural e industrial que recaen en las ventajas...
Ausführliche Beschreibung
Gespeichert in:
| Autor*in: |
Rojas Álvarez, Oscar Eduardo [verfasserIn] Bonilla Millán, Fernando [verfasserIn] Rodríguez Estrada, Jhon Alexander [verfasserIn] Rojas Álvarez, Oscar Eduardo [herausgeberIn] |
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| Format: |
E-Book |
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| Sprache: |
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| Erschienen: |
Colombia: Universidad Santiago de Cali ; 2018 |
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| Rechteinformationen: |
Open Access Creative Commons ; https://creativecommons.org/licenses/by/4.0 |
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| Schlagwörter: |
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| Umfang: |
1 Online-Ressource (47-92 p.) |
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| 520 | |a La vinaza de caña de azúcar, al ser un residuo producido en altas cantidades derivado de los procesos industriales para la producción de Etanol, es una mezcla de compuestos que tiene una utilidad cíclica para matrices de suelos debido a su composición natural e industrial que recaen en las ventajas y desventajas de sus aplicaciones. El potasio y el glicerol, compuestos mayoritarios en su composición, son ligandos que ayudan a la conformación de complejos proteicos con la vinaza para tener alternativas en los usos industriales como aditivos para alimento animal y fertilizantes en matrices de suelos, muchos de estos, utilizados en cultivos de las mismas industrias. Estudios de química computacional permiten conocer propiedades intermoleculares entre la vinaza, el glicerol y el potasio mediante in-eracciones moleculares estables convirtiéndola en una herramienta útil de evaluación de dichas propiedades y determinación de nuevas alternativas para usos industriales de este residuo. En esta investigación, se evaluó la dinámica de las interacciones intermoleculares entre el modelo proteínico tridimensional extraído del archivo de la base de datos de proteínas (PDB) por sus siglas en inglés, del modelo (2KSQ), el cual consiste en una proteína de membrana de la Echoli llamado Arf*GTP, con dos ligandos como potasio y glicerol mediante dinámica molecular utilizando un software llamado Dinámica Molecular Escalable por sus siglas en inglés, NAMD1. Se observaron y evaluaron las interacciones intermoleculares por medio del soft-ware llamado Visor de Dinámica Molecular por sus siglas en inglés, VMD2 de la molécula modelada de la proteína de membrana Arf*GTP con componentes mayoritarios, tales como, el potasio y el glicerol en un ambiente solvatado definido e implícito de modelo de caja de agua (TIP3) con el fin de identificar y caracterizar las fuerzas intermoleculares, equilibrio en trayectorias, fluctuaciones atómicas, afinidades, constantes de velocidad e interacciones Arf*GTP-Potasio, Arf*GTP-Glicerol y Arf*GTP-Potasio-Glicerol en el contexto de usos industriales de la vinaza como alimento animal y fertilizantes. Final-mente, se observó que los tres complejos Arf*GTP se ven favorecidos por afinidades posicionales de los ligandos como los aminoácidos GLN 155, para el caso del potasio, y para los gliceroles lo fueron GLY 27 y LYS 127, como también, apantallamientos de algunos átomos de los aminoácidos con los ligandos. Con esta investigación, se busca tener más información acerca de las interacciones intermoleculares y constantes de velocidad, equilibrio de trayectorias y afinidades químicas de la proteína de membrana Arf*GTP con otros ligandos orgánicos e inorgánicos que aporten nuevas alternativas industriales para el uso de la vinaza de caña de azúcar | ||
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El potasio y el glicerol, compuestos mayoritarios en su composición, son ligandos que ayudan a la conformación de complejos proteicos con la vinaza para tener alternativas en los usos industriales como aditivos para alimento animal y fertilizantes en matrices de suelos, muchos de estos, utilizados en cultivos de las mismas industrias. Estudios de química computacional permiten conocer propiedades intermoleculares entre la vinaza, el glicerol y el potasio mediante in-eracciones moleculares estables convirtiéndola en una herramienta útil de evaluación de dichas propiedades y determinación de nuevas alternativas para usos industriales de este residuo. En esta investigación, se evaluó la dinámica de las interacciones intermoleculares entre el modelo proteínico tridimensional extraído del archivo de la base de datos de proteínas (PDB) por sus siglas en inglés, del modelo (2KSQ), el cual consiste en una proteína de membrana de la Echoli llamado Arf*GTP, con dos ligandos como potasio y glicerol mediante dinámica molecular utilizando un software llamado Dinámica Molecular Escalable por sus siglas en inglés, NAMD1. Se observaron y evaluaron las interacciones intermoleculares por medio del soft-ware llamado Visor de Dinámica Molecular por sus siglas en inglés, VMD2 de la molécula modelada de la proteína de membrana Arf*GTP con componentes mayoritarios, tales como, el potasio y el glicerol en un ambiente solvatado definido e implícito de modelo de caja de agua (TIP3) con el fin de identificar y caracterizar las fuerzas intermoleculares, equilibrio en trayectorias, fluctuaciones atómicas, afinidades, constantes de velocidad e interacciones Arf*GTP-Potasio, Arf*GTP-Glicerol y Arf*GTP-Potasio-Glicerol en el contexto de usos industriales de la vinaza como alimento animal y fertilizantes. Final-mente, se observó que los tres complejos Arf*GTP se ven favorecidos por afinidades posicionales de los ligandos como los aminoácidos GLN 155, para el caso del potasio, y para los gliceroles lo fueron GLY 27 y LYS 127, como también, apantallamientos de algunos átomos de los aminoácidos con los ligandos. Con esta investigación, se busca tener más información acerca de las interacciones intermoleculares y constantes de velocidad, equilibrio de trayectorias y afinidades químicas de la proteína de membrana Arf*GTP con otros ligandos orgánicos e inorgánicos que aporten nuevas alternativas industriales para el uso de la vinaza de caña de azúcar Creative Commons https://creativecommons.org/licenses/by/4.0 cc Spanish Pollution control Bonilla Millán, Fernando verfasserin aut Rodríguez Estrada, Jhon Alexander verfasserin aut Rojas Álvarez, Oscar Eduardo herausgeberin edt https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 X:DOAB Verlag kostenfrei ZDB-94-OAB GBV_ILN_11 ISIL_DE-1a SYSFLAG_1 GBV_KXP GBV_ILN_20 ISIL_DE-84 GBV_ILN_22 ISIL_DE-18 GBV_ILN_23 ISIL_DE-830 GBV_ILN_24 ISIL_DE-8 GBV_ILN_30 ISIL_DE-104 GBV_ILN_31 ISIL_DE-27 GBV_ILN_39 ISIL_DE-547 GBV_ILN_40 ISIL_DE-7 GBV_ILN_60 ISIL_DE-705 GBV_ILN_63 ISIL_DE-Wim2 GBV_ILN_65 ISIL_DE-3 GBV_ILN_70 ISIL_DE-89 GBV_ILN_72 ISIL_DE-35 GBV_ILN_90 ISIL_DE-Hil2 GBV_ILN_91 ISIL_DE-HIL3 GBV_ILN_92 ISIL_DE-33 GBV_ILN_95 ISIL_DE-542 GBV_ILN_105 ISIL_DE-841 GBV_ILN_110 ISIL_DE-Luen4 GBV_ILN_130 ISIL_DE-700 GBV_ILN_131 ISIL_DE-Va1 GBV_ILN_132 ISIL_DE-959 GBV_ILN_136 ISIL_DE-Wis1 GBV_ILN_147 ISIL_DE-Fl3 GBV_ILN_161 ISIL_DE-960 GBV_ILN_213 ISIL_DE-551 GBV_ILN_230 ISIL_DE-552 GBV_ILN_283 ISIL_DE-Ha163 GBV_ILN_285 ISIL_DE-517 GBV_ILN_293 ISIL_DE-960-3 GBV_ILN_370 ISIL_DE-1373 GBV_ILN_635 ISIL_DE-B2138 GBV_ILN_808 GBV_ILN_2011 ISIL_DE-16 GBV_ILN_2014 ISIL_DE-90 GBV_ILN_2018 ISIL_DE-31 GBV_ILN_2034 ISIL_DE-Rt2 GBV_ILN_2037 ISIL_DE-747 GBV_ILN_2050 ISIL_DE-Zi4 GBV_ILN_2108 ISIL_DE-991 GBV_ILN_2403 ISIL_DE-LFER BO 11 01 0001 4258680486 00 5:LIZFREI --%%-- --%%-- --%%-- k 01-02-23 20 01 0084 4259825313 OLR-DOAB z 01-02-23 22 01 0018 4259001590 OLR-ZDB-94-OAB DOAB Directory of Open Access Books zu 01-02-23 23 01 0830 4259487523 olr-doab f z 01-02-23 24 01 0008 4260475428 OLR-doab z 01-02-23 30 01 0104 4259986767 OLR-OAB Open Access, Directory of Open Access Books (DOAB) z 01-02-23 31 01 0027 4259162144 OLR-DOAB z 01-02-23 39 01 0547 4260149407 OLR-ZDB-94-OAB ke 01-02-23 40 01 0007 4258841021 OLR-DOAB xsn 01-02-23 60 01 0705 4276624959 OPENAccess Vervielfältigungen (z.B. 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Die Weitergabe an Dritte sowie systematisches Downloaden sind untersagt. z 11-04-24 808 01 4808 4259664255 OLR-DOAB DOAB Directory of Open Access Books zg 01-02-23 2011 01 DE-16 4254607970 00 --%%-- --%%-- --%%-- --%%-- l01 29-01-23 2014 01 DE-90 4254909594 00 --%%-- --%%-- --%%-- --%%-- l01 30-01-23 2018 01 DE-31 4254607989 00 --%%-- --%%-- --%%-- n Der Zugriff ist kostenfrei möglich. l01 29-01-23 2034 01 DE-Rt2 4254607997 00 --%%-- eBook n n frei zugänglich l01 29-01-23 2037 01 DE-747 4345638127 00 --%%-- eBook OAPEN Foundation OpenAccess --%%-- n Im Internet frei verfügbar l01 30-06-23 2050 01 DE-Zi4 4254909608 00 --%%-- --%%-- --%%-- n Elektronischer Volltext - Open Access l01 30-01-23 2108 01 DE-991 4254608004 00 --%%-- eBook DOAB --%%-- n Elektronischer Volltext - Campuslizenz l01 29-01-23 2403 01 DE-LFER 4254909616 00 --%%-- --%%-- n --%%-- l01 30-01-23 20 01 0084 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 22 01 0018 Volltextzugang https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 23 01 0830 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 24 01 0008 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 30 01 0104 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 31 01 0027 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 40 01 0007 Volltext, Open Access https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 60 01 0705 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 63 01 3401 E-Book https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 65 01 0003 Open Access https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 65 01 0003 Dieser Titel ist Teil einer Datenbank http://www.bibliothek.uni-regensburg.de/dbinfo/detail.php?titel_id=11367&bib_id=ulb_hal 70 01 0089 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 72 01 0035 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 90 01 3090 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 91 01 3091 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 92 01 0033 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 95 01 3095 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 105 01 0841 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 110 01 3110 Open Access https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 130 01 0700 Open Access https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 131 01 3131 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 132 01 0959 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 136 01 3526 Open Access https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 147 01 3528 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 161 01 0960 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 LF 213 01 0551 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 230 01 0552 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 283 01 3283 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 285 01 0517 Open Access https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 293 01 3293 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 LF 370 01 4370 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 635 01 3635 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 808 01 4808 Volltextzugang https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 2011 01 DE-16 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 2014 01 DE-90 Volltext frei verfügbar https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 2034 01 DE-Rt2 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 2037 01 DE-747 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 2050 01 DE-Zi4 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 2108 01 DE-991 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 2403 01 DE-LFER https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 31 01 0027 00 E-Book Open Access 132 01 0959 00 EBooks DOAB Open Access 20 01 0084 OLR-DOAB 22 01 0018 OLR-ZDB-94-OAB 23 01 0830 olr-doab 24 01 0008 OLR-doab 24 01 0008 olr-frei 30 01 0104 OLR-OAB 31 01 0027 OLR-DOAB 39 01 0547 OLR-ZDB-94-OAB 39 01 0547 LF 40 01 0007 OLR-DOAB 60 01 0705 OPENAccess 63 01 3401 E-Books LF GBV-DOAB 65 01 0003 OLR-DOAB 70 01 0089 OLR-DOAB-OA 72 01 0035 OLR-ZDB-94-OAB 90 01 3090 OLR-HILoapen 91 01 3091 OLR-DOAB 92 01 0033 OLR-Open Access DOAB 95 01 3095 OLR-OAB 105 01 0841 OLR-OAB 110 01 3110 OLR-DOAB 130 01 0700 OLR-DOAB 131 01 3131 OLR-OA-DOAB 132 01 0959 OLR-OAB 136 01 3526 OLR-DOAB 147 01 3528 OLR-DOAB 161 01 0960 OLR-DOAB 213 01 0551 OLR-DOAB 230 01 0552 OLR-DOAB 285 01 0517 OLR-DOAB 293 01 3293 OLR-DOAB 370 01 4370 OLR-FREE 370 01 4370 olr-ebook ZDB-94-OAB 635 01 3635 OLR-DOAB 808 01 4808 OLR-DOAB |
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El potasio y el glicerol, compuestos mayoritarios en su composición, son ligandos que ayudan a la conformación de complejos proteicos con la vinaza para tener alternativas en los usos industriales como aditivos para alimento animal y fertilizantes en matrices de suelos, muchos de estos, utilizados en cultivos de las mismas industrias. Estudios de química computacional permiten conocer propiedades intermoleculares entre la vinaza, el glicerol y el potasio mediante in-eracciones moleculares estables convirtiéndola en una herramienta útil de evaluación de dichas propiedades y determinación de nuevas alternativas para usos industriales de este residuo. En esta investigación, se evaluó la dinámica de las interacciones intermoleculares entre el modelo proteínico tridimensional extraído del archivo de la base de datos de proteínas (PDB) por sus siglas en inglés, del modelo (2KSQ), el cual consiste en una proteína de membrana de la Echoli llamado Arf*GTP, con dos ligandos como potasio y glicerol mediante dinámica molecular utilizando un software llamado Dinámica Molecular Escalable por sus siglas en inglés, NAMD1. Se observaron y evaluaron las interacciones intermoleculares por medio del soft-ware llamado Visor de Dinámica Molecular por sus siglas en inglés, VMD2 de la molécula modelada de la proteína de membrana Arf*GTP con componentes mayoritarios, tales como, el potasio y el glicerol en un ambiente solvatado definido e implícito de modelo de caja de agua (TIP3) con el fin de identificar y caracterizar las fuerzas intermoleculares, equilibrio en trayectorias, fluctuaciones atómicas, afinidades, constantes de velocidad e interacciones Arf*GTP-Potasio, Arf*GTP-Glicerol y Arf*GTP-Potasio-Glicerol en el contexto de usos industriales de la vinaza como alimento animal y fertilizantes. Final-mente, se observó que los tres complejos Arf*GTP se ven favorecidos por afinidades posicionales de los ligandos como los aminoácidos GLN 155, para el caso del potasio, y para los gliceroles lo fueron GLY 27 y LYS 127, como también, apantallamientos de algunos átomos de los aminoácidos con los ligandos. Con esta investigación, se busca tener más información acerca de las interacciones intermoleculares y constantes de velocidad, equilibrio de trayectorias y afinidades químicas de la proteína de membrana Arf*GTP con otros ligandos orgánicos e inorgánicos que aporten nuevas alternativas industriales para el uso de la vinaza de caña de azúcar Creative Commons https://creativecommons.org/licenses/by/4.0 cc Spanish Pollution control Bonilla Millán, Fernando verfasserin aut Rodríguez Estrada, Jhon Alexander verfasserin aut Rojas Álvarez, Oscar Eduardo herausgeberin edt https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 X:DOAB Verlag kostenfrei ZDB-94-OAB GBV_ILN_11 ISIL_DE-1a SYSFLAG_1 GBV_KXP GBV_ILN_20 ISIL_DE-84 GBV_ILN_22 ISIL_DE-18 GBV_ILN_23 ISIL_DE-830 GBV_ILN_24 ISIL_DE-8 GBV_ILN_30 ISIL_DE-104 GBV_ILN_31 ISIL_DE-27 GBV_ILN_39 ISIL_DE-547 GBV_ILN_40 ISIL_DE-7 GBV_ILN_60 ISIL_DE-705 GBV_ILN_63 ISIL_DE-Wim2 GBV_ILN_65 ISIL_DE-3 GBV_ILN_70 ISIL_DE-89 GBV_ILN_72 ISIL_DE-35 GBV_ILN_90 ISIL_DE-Hil2 GBV_ILN_91 ISIL_DE-HIL3 GBV_ILN_92 ISIL_DE-33 GBV_ILN_95 ISIL_DE-542 GBV_ILN_105 ISIL_DE-841 GBV_ILN_110 ISIL_DE-Luen4 GBV_ILN_130 ISIL_DE-700 GBV_ILN_131 ISIL_DE-Va1 GBV_ILN_132 ISIL_DE-959 GBV_ILN_136 ISIL_DE-Wis1 GBV_ILN_147 ISIL_DE-Fl3 GBV_ILN_161 ISIL_DE-960 GBV_ILN_213 ISIL_DE-551 GBV_ILN_230 ISIL_DE-552 GBV_ILN_283 ISIL_DE-Ha163 GBV_ILN_285 ISIL_DE-517 GBV_ILN_293 ISIL_DE-960-3 GBV_ILN_370 ISIL_DE-1373 GBV_ILN_635 ISIL_DE-B2138 GBV_ILN_808 GBV_ILN_2011 ISIL_DE-16 GBV_ILN_2014 ISIL_DE-90 GBV_ILN_2018 ISIL_DE-31 GBV_ILN_2034 ISIL_DE-Rt2 GBV_ILN_2037 ISIL_DE-747 GBV_ILN_2050 ISIL_DE-Zi4 GBV_ILN_2108 ISIL_DE-991 GBV_ILN_2403 ISIL_DE-LFER BO 11 01 0001 4258680486 00 5:LIZFREI --%%-- --%%-- --%%-- k 01-02-23 20 01 0084 4259825313 OLR-DOAB z 01-02-23 22 01 0018 4259001590 OLR-ZDB-94-OAB DOAB Directory of Open Access Books zu 01-02-23 23 01 0830 4259487523 olr-doab f z 01-02-23 24 01 0008 4260475428 OLR-doab z 01-02-23 30 01 0104 4259986767 OLR-OAB Open Access, Directory of Open Access Books (DOAB) z 01-02-23 31 01 0027 4259162144 OLR-DOAB z 01-02-23 39 01 0547 4260149407 OLR-ZDB-94-OAB ke 01-02-23 40 01 0007 4258841021 OLR-DOAB xsn 01-02-23 60 01 0705 4276624959 OPENAccess Vervielfältigungen (z.B. 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Nur für Angehörige der HSU: Volltextzugang von außerhalb des Campus mit Anmeldung über Shibboleth mit Ihrer Bibliothekskennung z 25-02-23 63 01 3401 4261171295 E-Books LF GBV-DOAB z 01-02-23 65 01 0003 4261367084 OLR-DOAB Nach dem deutschen Urheberrecht darf das Werk bzw. der Inhalt zum eigenen Gebrauch kostenfrei heruntergeladen, konsumiert, gespeichert oder ausgedruckt, nicht jedoch im Internet bereitgestellt oder an Außenstehende weitergegeben werden! z 01-02-23 70 01 0089 4259325027 OLR-DOAB-OA DOAB Directory of Open Access Books z 01-02-23 72 01 0035 4256560947 OLR-ZDB-94-OAB DOAB Directory of Open Access Books z 31-01-23 90 01 3090 4260311778 OLR-HILoapen z 01-02-23 91 01 3091 4256902473 OLR-DOAB DOAB Directory of Open Access Books z 01-02-23 92 01 0033 4258354120 OLR-Open Access DOAB Vervielfältigungen (z.B. Kopien, Downloads) sind nur von einzelnen Kapiteln oder Seiten und nur zum eigenen wissenschaftlichen Gebrauch erlaubt. 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Die Weitergabe an Dritte sowie systematisches Downloaden sind untersagt. z 11-04-24 808 01 4808 4259664255 OLR-DOAB DOAB Directory of Open Access Books zg 01-02-23 2011 01 DE-16 4254607970 00 --%%-- --%%-- --%%-- --%%-- l01 29-01-23 2014 01 DE-90 4254909594 00 --%%-- --%%-- --%%-- --%%-- l01 30-01-23 2018 01 DE-31 4254607989 00 --%%-- --%%-- --%%-- n Der Zugriff ist kostenfrei möglich. l01 29-01-23 2034 01 DE-Rt2 4254607997 00 --%%-- eBook n n frei zugänglich l01 29-01-23 2037 01 DE-747 4345638127 00 --%%-- eBook OAPEN Foundation OpenAccess --%%-- n Im Internet frei verfügbar l01 30-06-23 2050 01 DE-Zi4 4254909608 00 --%%-- --%%-- --%%-- n Elektronischer Volltext - Open Access l01 30-01-23 2108 01 DE-991 4254608004 00 --%%-- eBook DOAB --%%-- n Elektronischer Volltext - Campuslizenz l01 29-01-23 2403 01 DE-LFER 4254909616 00 --%%-- --%%-- n --%%-- l01 30-01-23 20 01 0084 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 22 01 0018 Volltextzugang https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 23 01 0830 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 24 01 0008 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 30 01 0104 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 31 01 0027 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 40 01 0007 Volltext, Open Access https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 60 01 0705 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 63 01 3401 E-Book https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 65 01 0003 Open Access https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 65 01 0003 Dieser Titel ist Teil einer Datenbank http://www.bibliothek.uni-regensburg.de/dbinfo/detail.php?titel_id=11367&bib_id=ulb_hal 70 01 0089 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 72 01 0035 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 90 01 3090 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 91 01 3091 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 92 01 0033 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 95 01 3095 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 105 01 0841 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 110 01 3110 Open Access https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 130 01 0700 Open Access https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 131 01 3131 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 132 01 0959 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 136 01 3526 Open Access https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 147 01 3528 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 161 01 0960 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 LF 213 01 0551 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 230 01 0552 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 283 01 3283 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 285 01 0517 Open Access https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 293 01 3293 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 LF 370 01 4370 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 635 01 3635 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 808 01 4808 Volltextzugang https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 2011 01 DE-16 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 2014 01 DE-90 Volltext frei verfügbar https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 2034 01 DE-Rt2 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 2037 01 DE-747 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 2050 01 DE-Zi4 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 2108 01 DE-991 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 2403 01 DE-LFER https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 31 01 0027 00 E-Book Open Access 132 01 0959 00 EBooks DOAB Open Access 20 01 0084 OLR-DOAB 22 01 0018 OLR-ZDB-94-OAB 23 01 0830 olr-doab 24 01 0008 OLR-doab 24 01 0008 olr-frei 30 01 0104 OLR-OAB 31 01 0027 OLR-DOAB 39 01 0547 OLR-ZDB-94-OAB 39 01 0547 LF 40 01 0007 OLR-DOAB 60 01 0705 OPENAccess 63 01 3401 E-Books LF GBV-DOAB 65 01 0003 OLR-DOAB 70 01 0089 OLR-DOAB-OA 72 01 0035 OLR-ZDB-94-OAB 90 01 3090 OLR-HILoapen 91 01 3091 OLR-DOAB 92 01 0033 OLR-Open Access DOAB 95 01 3095 OLR-OAB 105 01 0841 OLR-OAB 110 01 3110 OLR-DOAB 130 01 0700 OLR-DOAB 131 01 3131 OLR-OA-DOAB 132 01 0959 OLR-OAB 136 01 3526 OLR-DOAB 147 01 3528 OLR-DOAB 161 01 0960 OLR-DOAB 213 01 0551 OLR-DOAB 230 01 0552 OLR-DOAB 285 01 0517 OLR-DOAB 293 01 3293 OLR-DOAB 370 01 4370 OLR-FREE 370 01 4370 olr-ebook ZDB-94-OAB 635 01 3635 OLR-DOAB 808 01 4808 OLR-DOAB |
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El potasio y el glicerol, compuestos mayoritarios en su composición, son ligandos que ayudan a la conformación de complejos proteicos con la vinaza para tener alternativas en los usos industriales como aditivos para alimento animal y fertilizantes en matrices de suelos, muchos de estos, utilizados en cultivos de las mismas industrias. Estudios de química computacional permiten conocer propiedades intermoleculares entre la vinaza, el glicerol y el potasio mediante in-eracciones moleculares estables convirtiéndola en una herramienta útil de evaluación de dichas propiedades y determinación de nuevas alternativas para usos industriales de este residuo. En esta investigación, se evaluó la dinámica de las interacciones intermoleculares entre el modelo proteínico tridimensional extraído del archivo de la base de datos de proteínas (PDB) por sus siglas en inglés, del modelo (2KSQ), el cual consiste en una proteína de membrana de la Echoli llamado Arf*GTP, con dos ligandos como potasio y glicerol mediante dinámica molecular utilizando un software llamado Dinámica Molecular Escalable por sus siglas en inglés, NAMD1. Se observaron y evaluaron las interacciones intermoleculares por medio del soft-ware llamado Visor de Dinámica Molecular por sus siglas en inglés, VMD2 de la molécula modelada de la proteína de membrana Arf*GTP con componentes mayoritarios, tales como, el potasio y el glicerol en un ambiente solvatado definido e implícito de modelo de caja de agua (TIP3) con el fin de identificar y caracterizar las fuerzas intermoleculares, equilibrio en trayectorias, fluctuaciones atómicas, afinidades, constantes de velocidad e interacciones Arf*GTP-Potasio, Arf*GTP-Glicerol y Arf*GTP-Potasio-Glicerol en el contexto de usos industriales de la vinaza como alimento animal y fertilizantes. Final-mente, se observó que los tres complejos Arf*GTP se ven favorecidos por afinidades posicionales de los ligandos como los aminoácidos GLN 155, para el caso del potasio, y para los gliceroles lo fueron GLY 27 y LYS 127, como también, apantallamientos de algunos átomos de los aminoácidos con los ligandos. Con esta investigación, se busca tener más información acerca de las interacciones intermoleculares y constantes de velocidad, equilibrio de trayectorias y afinidades químicas de la proteína de membrana Arf*GTP con otros ligandos orgánicos e inorgánicos que aporten nuevas alternativas industriales para el uso de la vinaza de caña de azúcar Creative Commons https://creativecommons.org/licenses/by/4.0 cc Spanish Pollution control Bonilla Millán, Fernando verfasserin aut Rodríguez Estrada, Jhon Alexander verfasserin aut Rojas Álvarez, Oscar Eduardo herausgeberin edt https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 X:DOAB Verlag kostenfrei ZDB-94-OAB GBV_ILN_11 ISIL_DE-1a SYSFLAG_1 GBV_KXP GBV_ILN_20 ISIL_DE-84 GBV_ILN_22 ISIL_DE-18 GBV_ILN_23 ISIL_DE-830 GBV_ILN_24 ISIL_DE-8 GBV_ILN_30 ISIL_DE-104 GBV_ILN_31 ISIL_DE-27 GBV_ILN_39 ISIL_DE-547 GBV_ILN_40 ISIL_DE-7 GBV_ILN_60 ISIL_DE-705 GBV_ILN_63 ISIL_DE-Wim2 GBV_ILN_65 ISIL_DE-3 GBV_ILN_70 ISIL_DE-89 GBV_ILN_72 ISIL_DE-35 GBV_ILN_90 ISIL_DE-Hil2 GBV_ILN_91 ISIL_DE-HIL3 GBV_ILN_92 ISIL_DE-33 GBV_ILN_95 ISIL_DE-542 GBV_ILN_105 ISIL_DE-841 GBV_ILN_110 ISIL_DE-Luen4 GBV_ILN_130 ISIL_DE-700 GBV_ILN_131 ISIL_DE-Va1 GBV_ILN_132 ISIL_DE-959 GBV_ILN_136 ISIL_DE-Wis1 GBV_ILN_147 ISIL_DE-Fl3 GBV_ILN_161 ISIL_DE-960 GBV_ILN_213 ISIL_DE-551 GBV_ILN_230 ISIL_DE-552 GBV_ILN_283 ISIL_DE-Ha163 GBV_ILN_285 ISIL_DE-517 GBV_ILN_293 ISIL_DE-960-3 GBV_ILN_370 ISIL_DE-1373 GBV_ILN_635 ISIL_DE-B2138 GBV_ILN_808 GBV_ILN_2011 ISIL_DE-16 GBV_ILN_2014 ISIL_DE-90 GBV_ILN_2018 ISIL_DE-31 GBV_ILN_2034 ISIL_DE-Rt2 GBV_ILN_2037 ISIL_DE-747 GBV_ILN_2050 ISIL_DE-Zi4 GBV_ILN_2108 ISIL_DE-991 GBV_ILN_2403 ISIL_DE-LFER BO 11 01 0001 4258680486 00 5:LIZFREI --%%-- --%%-- --%%-- k 01-02-23 20 01 0084 4259825313 OLR-DOAB z 01-02-23 22 01 0018 4259001590 OLR-ZDB-94-OAB DOAB Directory of Open Access Books zu 01-02-23 23 01 0830 4259487523 olr-doab f z 01-02-23 24 01 0008 4260475428 OLR-doab z 01-02-23 30 01 0104 4259986767 OLR-OAB Open Access, Directory of Open Access Books (DOAB) z 01-02-23 31 01 0027 4259162144 OLR-DOAB z 01-02-23 39 01 0547 4260149407 OLR-ZDB-94-OAB ke 01-02-23 40 01 0007 4258841021 OLR-DOAB xsn 01-02-23 60 01 0705 4276624959 OPENAccess Vervielfältigungen (z.B. 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Nur für Angehörige der HSU: Volltextzugang von außerhalb des Campus mit Anmeldung über Shibboleth mit Ihrer Bibliothekskennung z 25-02-23 63 01 3401 4261171295 E-Books LF GBV-DOAB z 01-02-23 65 01 0003 4261367084 OLR-DOAB Nach dem deutschen Urheberrecht darf das Werk bzw. der Inhalt zum eigenen Gebrauch kostenfrei heruntergeladen, konsumiert, gespeichert oder ausgedruckt, nicht jedoch im Internet bereitgestellt oder an Außenstehende weitergegeben werden! z 01-02-23 70 01 0089 4259325027 OLR-DOAB-OA DOAB Directory of Open Access Books z 01-02-23 72 01 0035 4256560947 OLR-ZDB-94-OAB DOAB Directory of Open Access Books z 31-01-23 90 01 3090 4260311778 OLR-HILoapen z 01-02-23 91 01 3091 4256902473 OLR-DOAB DOAB Directory of Open Access Books z 01-02-23 92 01 0033 4258354120 OLR-Open Access DOAB Vervielfältigungen (z.B. Kopien, Downloads) sind nur von einzelnen Kapiteln oder Seiten und nur zum eigenen wissenschaftlichen Gebrauch erlaubt. 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Die Weitergabe an Dritte sowie systematisches Downloaden sind untersagt. z 11-04-24 808 01 4808 4259664255 OLR-DOAB DOAB Directory of Open Access Books zg 01-02-23 2011 01 DE-16 4254607970 00 --%%-- --%%-- --%%-- --%%-- l01 29-01-23 2014 01 DE-90 4254909594 00 --%%-- --%%-- --%%-- --%%-- l01 30-01-23 2018 01 DE-31 4254607989 00 --%%-- --%%-- --%%-- n Der Zugriff ist kostenfrei möglich. l01 29-01-23 2034 01 DE-Rt2 4254607997 00 --%%-- eBook n n frei zugänglich l01 29-01-23 2037 01 DE-747 4345638127 00 --%%-- eBook OAPEN Foundation OpenAccess --%%-- n Im Internet frei verfügbar l01 30-06-23 2050 01 DE-Zi4 4254909608 00 --%%-- --%%-- --%%-- n Elektronischer Volltext - Open Access l01 30-01-23 2108 01 DE-991 4254608004 00 --%%-- eBook DOAB --%%-- n Elektronischer Volltext - Campuslizenz l01 29-01-23 2403 01 DE-LFER 4254909616 00 --%%-- --%%-- n --%%-- l01 30-01-23 20 01 0084 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 22 01 0018 Volltextzugang https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 23 01 0830 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 24 01 0008 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 30 01 0104 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 31 01 0027 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 40 01 0007 Volltext, Open Access https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 60 01 0705 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 63 01 3401 E-Book https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 65 01 0003 Open Access https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 65 01 0003 Dieser Titel ist Teil einer Datenbank http://www.bibliothek.uni-regensburg.de/dbinfo/detail.php?titel_id=11367&bib_id=ulb_hal 70 01 0089 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 72 01 0035 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 90 01 3090 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 91 01 3091 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 92 01 0033 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 95 01 3095 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 105 01 0841 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 110 01 3110 Open Access https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 130 01 0700 Open Access https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 131 01 3131 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 132 01 0959 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 136 01 3526 Open Access https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 147 01 3528 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 161 01 0960 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 LF 213 01 0551 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 230 01 0552 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 283 01 3283 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 285 01 0517 Open Access https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 293 01 3293 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 LF 370 01 4370 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 635 01 3635 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 808 01 4808 Volltextzugang https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 2011 01 DE-16 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 2014 01 DE-90 Volltext frei verfügbar https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 2034 01 DE-Rt2 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 2037 01 DE-747 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 2050 01 DE-Zi4 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 2108 01 DE-991 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 2403 01 DE-LFER https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 31 01 0027 00 E-Book Open Access 132 01 0959 00 EBooks DOAB Open Access 20 01 0084 OLR-DOAB 22 01 0018 OLR-ZDB-94-OAB 23 01 0830 olr-doab 24 01 0008 OLR-doab 24 01 0008 olr-frei 30 01 0104 OLR-OAB 31 01 0027 OLR-DOAB 39 01 0547 OLR-ZDB-94-OAB 39 01 0547 LF 40 01 0007 OLR-DOAB 60 01 0705 OPENAccess 63 01 3401 E-Books LF GBV-DOAB 65 01 0003 OLR-DOAB 70 01 0089 OLR-DOAB-OA 72 01 0035 OLR-ZDB-94-OAB 90 01 3090 OLR-HILoapen 91 01 3091 OLR-DOAB 92 01 0033 OLR-Open Access DOAB 95 01 3095 OLR-OAB 105 01 0841 OLR-OAB 110 01 3110 OLR-DOAB 130 01 0700 OLR-DOAB 131 01 3131 OLR-OA-DOAB 132 01 0959 OLR-OAB 136 01 3526 OLR-DOAB 147 01 3528 OLR-DOAB 161 01 0960 OLR-DOAB 213 01 0551 OLR-DOAB 230 01 0552 OLR-DOAB 285 01 0517 OLR-DOAB 293 01 3293 OLR-DOAB 370 01 4370 OLR-FREE 370 01 4370 olr-ebook ZDB-94-OAB 635 01 3635 OLR-DOAB 808 01 4808 OLR-DOAB |
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El potasio y el glicerol, compuestos mayoritarios en su composición, son ligandos que ayudan a la conformación de complejos proteicos con la vinaza para tener alternativas en los usos industriales como aditivos para alimento animal y fertilizantes en matrices de suelos, muchos de estos, utilizados en cultivos de las mismas industrias. Estudios de química computacional permiten conocer propiedades intermoleculares entre la vinaza, el glicerol y el potasio mediante in-eracciones moleculares estables convirtiéndola en una herramienta útil de evaluación de dichas propiedades y determinación de nuevas alternativas para usos industriales de este residuo. En esta investigación, se evaluó la dinámica de las interacciones intermoleculares entre el modelo proteínico tridimensional extraído del archivo de la base de datos de proteínas (PDB) por sus siglas en inglés, del modelo (2KSQ), el cual consiste en una proteína de membrana de la Echoli llamado Arf*GTP, con dos ligandos como potasio y glicerol mediante dinámica molecular utilizando un software llamado Dinámica Molecular Escalable por sus siglas en inglés, NAMD1. Se observaron y evaluaron las interacciones intermoleculares por medio del soft-ware llamado Visor de Dinámica Molecular por sus siglas en inglés, VMD2 de la molécula modelada de la proteína de membrana Arf*GTP con componentes mayoritarios, tales como, el potasio y el glicerol en un ambiente solvatado definido e implícito de modelo de caja de agua (TIP3) con el fin de identificar y caracterizar las fuerzas intermoleculares, equilibrio en trayectorias, fluctuaciones atómicas, afinidades, constantes de velocidad e interacciones Arf*GTP-Potasio, Arf*GTP-Glicerol y Arf*GTP-Potasio-Glicerol en el contexto de usos industriales de la vinaza como alimento animal y fertilizantes. Final-mente, se observó que los tres complejos Arf*GTP se ven favorecidos por afinidades posicionales de los ligandos como los aminoácidos GLN 155, para el caso del potasio, y para los gliceroles lo fueron GLY 27 y LYS 127, como también, apantallamientos de algunos átomos de los aminoácidos con los ligandos. Con esta investigación, se busca tener más información acerca de las interacciones intermoleculares y constantes de velocidad, equilibrio de trayectorias y afinidades químicas de la proteína de membrana Arf*GTP con otros ligandos orgánicos e inorgánicos que aporten nuevas alternativas industriales para el uso de la vinaza de caña de azúcar Creative Commons https://creativecommons.org/licenses/by/4.0 cc Spanish Pollution control Bonilla Millán, Fernando verfasserin aut Rodríguez Estrada, Jhon Alexander verfasserin aut Rojas Álvarez, Oscar Eduardo herausgeberin edt https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 X:DOAB Verlag kostenfrei ZDB-94-OAB GBV_ILN_11 ISIL_DE-1a SYSFLAG_1 GBV_KXP GBV_ILN_20 ISIL_DE-84 GBV_ILN_22 ISIL_DE-18 GBV_ILN_23 ISIL_DE-830 GBV_ILN_24 ISIL_DE-8 GBV_ILN_30 ISIL_DE-104 GBV_ILN_31 ISIL_DE-27 GBV_ILN_39 ISIL_DE-547 GBV_ILN_40 ISIL_DE-7 GBV_ILN_60 ISIL_DE-705 GBV_ILN_63 ISIL_DE-Wim2 GBV_ILN_65 ISIL_DE-3 GBV_ILN_70 ISIL_DE-89 GBV_ILN_72 ISIL_DE-35 GBV_ILN_90 ISIL_DE-Hil2 GBV_ILN_91 ISIL_DE-HIL3 GBV_ILN_92 ISIL_DE-33 GBV_ILN_95 ISIL_DE-542 GBV_ILN_105 ISIL_DE-841 GBV_ILN_110 ISIL_DE-Luen4 GBV_ILN_130 ISIL_DE-700 GBV_ILN_131 ISIL_DE-Va1 GBV_ILN_132 ISIL_DE-959 GBV_ILN_136 ISIL_DE-Wis1 GBV_ILN_147 ISIL_DE-Fl3 GBV_ILN_161 ISIL_DE-960 GBV_ILN_213 ISIL_DE-551 GBV_ILN_230 ISIL_DE-552 GBV_ILN_283 ISIL_DE-Ha163 GBV_ILN_285 ISIL_DE-517 GBV_ILN_293 ISIL_DE-960-3 GBV_ILN_370 ISIL_DE-1373 GBV_ILN_635 ISIL_DE-B2138 GBV_ILN_808 GBV_ILN_2011 ISIL_DE-16 GBV_ILN_2014 ISIL_DE-90 GBV_ILN_2018 ISIL_DE-31 GBV_ILN_2034 ISIL_DE-Rt2 GBV_ILN_2037 ISIL_DE-747 GBV_ILN_2050 ISIL_DE-Zi4 GBV_ILN_2108 ISIL_DE-991 GBV_ILN_2403 ISIL_DE-LFER BO 11 01 0001 4258680486 00 5:LIZFREI --%%-- --%%-- --%%-- k 01-02-23 20 01 0084 4259825313 OLR-DOAB z 01-02-23 22 01 0018 4259001590 OLR-ZDB-94-OAB DOAB Directory of Open Access Books zu 01-02-23 23 01 0830 4259487523 olr-doab f z 01-02-23 24 01 0008 4260475428 OLR-doab z 01-02-23 30 01 0104 4259986767 OLR-OAB Open Access, Directory of Open Access Books (DOAB) z 01-02-23 31 01 0027 4259162144 OLR-DOAB z 01-02-23 39 01 0547 4260149407 OLR-ZDB-94-OAB ke 01-02-23 40 01 0007 4258841021 OLR-DOAB xsn 01-02-23 60 01 0705 4276624959 OPENAccess Vervielfältigungen (z.B. 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Nur für Angehörige der HSU: Volltextzugang von außerhalb des Campus mit Anmeldung über Shibboleth mit Ihrer Bibliothekskennung z 25-02-23 63 01 3401 4261171295 E-Books LF GBV-DOAB z 01-02-23 65 01 0003 4261367084 OLR-DOAB Nach dem deutschen Urheberrecht darf das Werk bzw. der Inhalt zum eigenen Gebrauch kostenfrei heruntergeladen, konsumiert, gespeichert oder ausgedruckt, nicht jedoch im Internet bereitgestellt oder an Außenstehende weitergegeben werden! z 01-02-23 70 01 0089 4259325027 OLR-DOAB-OA DOAB Directory of Open Access Books z 01-02-23 72 01 0035 4256560947 OLR-ZDB-94-OAB DOAB Directory of Open Access Books z 31-01-23 90 01 3090 4260311778 OLR-HILoapen z 01-02-23 91 01 3091 4256902473 OLR-DOAB DOAB Directory of Open Access Books z 01-02-23 92 01 0033 4258354120 OLR-Open Access DOAB Vervielfältigungen (z.B. Kopien, Downloads) sind nur von einzelnen Kapiteln oder Seiten und nur zum eigenen wissenschaftlichen Gebrauch erlaubt. 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Die Weitergabe an Dritte sowie systematisches Downloaden sind untersagt. z 11-04-24 808 01 4808 4259664255 OLR-DOAB DOAB Directory of Open Access Books zg 01-02-23 2011 01 DE-16 4254607970 00 --%%-- --%%-- --%%-- --%%-- l01 29-01-23 2014 01 DE-90 4254909594 00 --%%-- --%%-- --%%-- --%%-- l01 30-01-23 2018 01 DE-31 4254607989 00 --%%-- --%%-- --%%-- n Der Zugriff ist kostenfrei möglich. l01 29-01-23 2034 01 DE-Rt2 4254607997 00 --%%-- eBook n n frei zugänglich l01 29-01-23 2037 01 DE-747 4345638127 00 --%%-- eBook OAPEN Foundation OpenAccess --%%-- n Im Internet frei verfügbar l01 30-06-23 2050 01 DE-Zi4 4254909608 00 --%%-- --%%-- --%%-- n Elektronischer Volltext - Open Access l01 30-01-23 2108 01 DE-991 4254608004 00 --%%-- eBook DOAB --%%-- n Elektronischer Volltext - Campuslizenz l01 29-01-23 2403 01 DE-LFER 4254909616 00 --%%-- --%%-- n --%%-- l01 30-01-23 20 01 0084 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 22 01 0018 Volltextzugang https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 23 01 0830 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 24 01 0008 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 30 01 0104 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 31 01 0027 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 40 01 0007 Volltext, Open Access https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 60 01 0705 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 63 01 3401 E-Book https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 65 01 0003 Open Access https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 65 01 0003 Dieser Titel ist Teil einer Datenbank http://www.bibliothek.uni-regensburg.de/dbinfo/detail.php?titel_id=11367&bib_id=ulb_hal 70 01 0089 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 72 01 0035 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 90 01 3090 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 91 01 3091 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 92 01 0033 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 95 01 3095 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 105 01 0841 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 110 01 3110 Open Access https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 130 01 0700 Open Access https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 131 01 3131 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 132 01 0959 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 136 01 3526 Open Access https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 147 01 3528 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 161 01 0960 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 LF 213 01 0551 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 230 01 0552 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 283 01 3283 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 285 01 0517 Open Access https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 293 01 3293 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 LF 370 01 4370 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 635 01 3635 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 808 01 4808 Volltextzugang https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 2011 01 DE-16 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 2014 01 DE-90 Volltext frei verfügbar https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 2034 01 DE-Rt2 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 2037 01 DE-747 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 2050 01 DE-Zi4 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 2108 01 DE-991 https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 2403 01 DE-LFER https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 31 01 0027 00 E-Book Open Access 132 01 0959 00 EBooks DOAB Open Access 20 01 0084 OLR-DOAB 22 01 0018 OLR-ZDB-94-OAB 23 01 0830 olr-doab 24 01 0008 OLR-doab 24 01 0008 olr-frei 30 01 0104 OLR-OAB 31 01 0027 OLR-DOAB 39 01 0547 OLR-ZDB-94-OAB 39 01 0547 LF 40 01 0007 OLR-DOAB 60 01 0705 OPENAccess 63 01 3401 E-Books LF GBV-DOAB 65 01 0003 OLR-DOAB 70 01 0089 OLR-DOAB-OA 72 01 0035 OLR-ZDB-94-OAB 90 01 3090 OLR-HILoapen 91 01 3091 OLR-DOAB 92 01 0033 OLR-Open Access DOAB 95 01 3095 OLR-OAB 105 01 0841 OLR-OAB 110 01 3110 OLR-DOAB 130 01 0700 OLR-DOAB 131 01 3131 OLR-OA-DOAB 132 01 0959 OLR-OAB 136 01 3526 OLR-DOAB 147 01 3528 OLR-DOAB 161 01 0960 OLR-DOAB 213 01 0551 OLR-DOAB 230 01 0552 OLR-DOAB 285 01 0517 OLR-DOAB 293 01 3293 OLR-DOAB 370 01 4370 OLR-FREE 370 01 4370 olr-ebook ZDB-94-OAB 635 01 3635 OLR-DOAB 808 01 4808 OLR-DOAB |
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El potasio y el glicerol, compuestos mayoritarios en su composición, son ligandos que ayudan a la conformación de complejos proteicos con la vinaza para tener alternativas en los usos industriales como aditivos para alimento animal y fertilizantes en matrices de suelos, muchos de estos, utilizados en cultivos de las mismas industrias. Estudios de química computacional permiten conocer propiedades intermoleculares entre la vinaza, el glicerol y el potasio mediante in-eracciones moleculares estables convirtiéndola en una herramienta útil de evaluación de dichas propiedades y determinación de nuevas alternativas para usos industriales de este residuo. En esta investigación, se evaluó la dinámica de las interacciones intermoleculares entre el modelo proteínico tridimensional extraído del archivo de la base de datos de proteínas (PDB) por sus siglas en inglés, del modelo (2KSQ), el cual consiste en una proteína de membrana de la Echoli llamado Arf*GTP, con dos ligandos como potasio y glicerol mediante dinámica molecular utilizando un software llamado Dinámica Molecular Escalable por sus siglas en inglés, NAMD1. Se observaron y evaluaron las interacciones intermoleculares por medio del soft-ware llamado Visor de Dinámica Molecular por sus siglas en inglés, VMD2 de la molécula modelada de la proteína de membrana Arf*GTP con componentes mayoritarios, tales como, el potasio y el glicerol en un ambiente solvatado definido e implícito de modelo de caja de agua (TIP3) con el fin de identificar y caracterizar las fuerzas intermoleculares, equilibrio en trayectorias, fluctuaciones atómicas, afinidades, constantes de velocidad e interacciones Arf*GTP-Potasio, Arf*GTP-Glicerol y Arf*GTP-Potasio-Glicerol en el contexto de usos industriales de la vinaza como alimento animal y fertilizantes. Final-mente, se observó que los tres complejos Arf*GTP se ven favorecidos por afinidades posicionales de los ligandos como los aminoácidos GLN 155, para el caso del potasio, y para los gliceroles lo fueron GLY 27 y LYS 127, como también, apantallamientos de algunos átomos de los aminoácidos con los ligandos. Con esta investigación, se busca tener más información acerca de las interacciones intermoleculares y constantes de velocidad, equilibrio de trayectorias y afinidades químicas de la proteína de membrana Arf*GTP con otros ligandos orgánicos e inorgánicos que aporten nuevas alternativas industriales para el uso de la vinaza de caña de azúcar Creative Commons https://creativecommons.org/licenses/by/4.0 cc Spanish Pollution control Bonilla Millán, Fernando verfasserin aut Rodríguez Estrada, Jhon Alexander verfasserin aut Rojas Álvarez, Oscar Eduardo herausgeberin edt https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2 X:DOAB Verlag kostenfrei ZDB-94-OAB GBV_ILN_11 ISIL_DE-1a SYSFLAG_1 GBV_KXP GBV_ILN_20 ISIL_DE-84 GBV_ILN_22 ISIL_DE-18 GBV_ILN_23 ISIL_DE-830 GBV_ILN_24 ISIL_DE-8 GBV_ILN_30 ISIL_DE-104 GBV_ILN_31 ISIL_DE-27 GBV_ILN_39 ISIL_DE-547 GBV_ILN_40 ISIL_DE-7 GBV_ILN_60 ISIL_DE-705 GBV_ILN_63 ISIL_DE-Wim2 GBV_ILN_65 ISIL_DE-3 GBV_ILN_70 ISIL_DE-89 GBV_ILN_72 ISIL_DE-35 GBV_ILN_90 ISIL_DE-Hil2 GBV_ILN_91 ISIL_DE-HIL3 GBV_ILN_92 ISIL_DE-33 GBV_ILN_95 ISIL_DE-542 GBV_ILN_105 ISIL_DE-841 GBV_ILN_110 ISIL_DE-Luen4 GBV_ILN_130 ISIL_DE-700 GBV_ILN_131 ISIL_DE-Va1 GBV_ILN_132 ISIL_DE-959 GBV_ILN_136 ISIL_DE-Wis1 GBV_ILN_147 ISIL_DE-Fl3 GBV_ILN_161 ISIL_DE-960 GBV_ILN_213 ISIL_DE-551 GBV_ILN_230 ISIL_DE-552 GBV_ILN_283 ISIL_DE-Ha163 GBV_ILN_285 ISIL_DE-517 GBV_ILN_293 ISIL_DE-960-3 GBV_ILN_370 ISIL_DE-1373 GBV_ILN_635 ISIL_DE-B2138 GBV_ILN_808 GBV_ILN_2011 ISIL_DE-16 GBV_ILN_2014 ISIL_DE-90 GBV_ILN_2018 ISIL_DE-31 GBV_ILN_2034 ISIL_DE-Rt2 GBV_ILN_2037 ISIL_DE-747 GBV_ILN_2050 ISIL_DE-Zi4 GBV_ILN_2108 ISIL_DE-991 GBV_ILN_2403 ISIL_DE-LFER BO 11 01 0001 4258680486 00 5:LIZFREI --%%-- --%%-- --%%-- k 01-02-23 20 01 0084 4259825313 OLR-DOAB z 01-02-23 22 01 0018 4259001590 OLR-ZDB-94-OAB DOAB Directory of Open Access Books zu 01-02-23 23 01 0830 4259487523 olr-doab f z 01-02-23 24 01 0008 4260475428 OLR-doab z 01-02-23 30 01 0104 4259986767 OLR-OAB Open Access, Directory of Open Access Books (DOAB) z 01-02-23 31 01 0027 4259162144 OLR-DOAB z 01-02-23 39 01 0547 4260149407 OLR-ZDB-94-OAB ke 01-02-23 40 01 0007 4258841021 OLR-DOAB xsn 01-02-23 60 01 0705 4276624959 OPENAccess Vervielfältigungen (z.B. 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Nur für Angehörige der HSU: Volltextzugang von außerhalb des Campus mit Anmeldung über Shibboleth mit Ihrer Bibliothekskennung z 25-02-23 63 01 3401 4261171295 E-Books LF GBV-DOAB z 01-02-23 65 01 0003 4261367084 OLR-DOAB Nach dem deutschen Urheberrecht darf das Werk bzw. der Inhalt zum eigenen Gebrauch kostenfrei heruntergeladen, konsumiert, gespeichert oder ausgedruckt, nicht jedoch im Internet bereitgestellt oder an Außenstehende weitergegeben werden! z 01-02-23 70 01 0089 4259325027 OLR-DOAB-OA DOAB Directory of Open Access Books z 01-02-23 72 01 0035 4256560947 OLR-ZDB-94-OAB DOAB Directory of Open Access Books z 31-01-23 90 01 3090 4260311778 OLR-HILoapen z 01-02-23 91 01 3091 4256902473 OLR-DOAB DOAB Directory of Open Access Books z 01-02-23 92 01 0033 4258354120 OLR-Open Access DOAB Vervielfältigungen (z.B. Kopien, Downloads) sind nur von einzelnen Kapiteln oder Seiten und nur zum eigenen wissenschaftlichen Gebrauch erlaubt. 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El potasio y el glicerol, compuestos mayoritarios en su composición, son ligandos que ayudan a la conformación de complejos proteicos con la vinaza para tener alternativas en los usos industriales como aditivos para alimento animal y fertilizantes en matrices de suelos, muchos de estos, utilizados en cultivos de las mismas industrias. Estudios de química computacional permiten conocer propiedades intermoleculares entre la vinaza, el glicerol y el potasio mediante in-eracciones moleculares estables convirtiéndola en una herramienta útil de evaluación de dichas propiedades y determinación de nuevas alternativas para usos industriales de este residuo. En esta investigación, se evaluó la dinámica de las interacciones intermoleculares entre el modelo proteínico tridimensional extraído del archivo de la base de datos de proteínas (PDB) por sus siglas en inglés, del modelo (2KSQ), el cual consiste en una proteína de membrana de la Echoli llamado Arf*GTP, con dos ligandos como potasio y glicerol mediante dinámica molecular utilizando un software llamado Dinámica Molecular Escalable por sus siglas en inglés, NAMD1. Se observaron y evaluaron las interacciones intermoleculares por medio del soft-ware llamado Visor de Dinámica Molecular por sus siglas en inglés, VMD2 de la molécula modelada de la proteína de membrana Arf*GTP con componentes mayoritarios, tales como, el potasio y el glicerol en un ambiente solvatado definido e implícito de modelo de caja de agua (TIP3) con el fin de identificar y caracterizar las fuerzas intermoleculares, equilibrio en trayectorias, fluctuaciones atómicas, afinidades, constantes de velocidad e interacciones Arf*GTP-Potasio, Arf*GTP-Glicerol y Arf*GTP-Potasio-Glicerol en el contexto de usos industriales de la vinaza como alimento animal y fertilizantes. Final-mente, se observó que los tres complejos Arf*GTP se ven favorecidos por afinidades posicionales de los ligandos como los aminoácidos GLN 155, para el caso del potasio, y para los gliceroles lo fueron GLY 27 y LYS 127, como también, apantallamientos de algunos átomos de los aminoácidos con los ligandos. Con esta investigación, se busca tener más información acerca de las interacciones intermoleculares y constantes de velocidad, equilibrio de trayectorias y afinidades químicas de la proteína de membrana Arf*GTP con otros ligandos orgánicos e inorgánicos que aporten nuevas alternativas industriales para el uso de la vinaza de caña de azúcar</subfield></datafield><datafield tag="540" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">Creative Commons</subfield><subfield code="f">https://creativecommons.org/licenses/by/4.0</subfield><subfield code="2">cc</subfield></datafield><datafield tag="546" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">Spanish</subfield></datafield><datafield tag="650" ind1=" " ind2="4"><subfield code="a">Pollution control</subfield></datafield><datafield tag="700" ind1="1" ind2=" "><subfield code="a">Bonilla Millán, Fernando</subfield><subfield code="e">verfasserin</subfield><subfield code="4">aut</subfield></datafield><datafield tag="700" ind1="1" ind2=" "><subfield code="a">Rodríguez 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Kopien, Downloads) sind nur von einzelnen Kapiteln oder Seiten und nur zum eigenen wissenschaftlichen Gebrauch erlaubt. Keine Weitergabe an Dritte. 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Kopien, Downloads) sind nur von einzelnen Kapiteln oder Seiten und nur zum eigenen wissenschaftlichen Gebrauch erlaubt. Die Weitergabe an Dritte sowie systematisches Downloaden sind untersagt. Das Ebook ist frei zugänglich.</subfield><subfield code="y">z</subfield><subfield code="z">01-02-23</subfield></datafield><datafield tag="980" ind1=" " ind2=" "><subfield code="2">95</subfield><subfield code="1">01</subfield><subfield code="x">3095</subfield><subfield code="b">4343003671</subfield><subfield code="h">OLR-OAB</subfield><subfield code="k">Vervielfältigungen (z.B. Kopien, Downloads) sind nur von einzelnen Kapiteln oder Seiten und nur zum eigenen wissenschaftlichen Gebrauch erlaubt. Die Weitergabe an Dritte sowie systematisches Downloaden sind untersagt.</subfield><subfield code="y">z</subfield><subfield code="z">24-06-23</subfield></datafield><datafield tag="980" ind1=" " ind2=" "><subfield code="2">105</subfield><subfield code="1">01</subfield><subfield code="x">0841</subfield><subfield code="b">4261741032</subfield><subfield code="h">OLR-OAB</subfield><subfield code="k">Vervielfältigungen (z.B. Kopien, Downloads) sind nur von einzelnen Kapiteln oder Seiten und nur zum eigenen wissenschaftlichen Gebrauch erlaubt. Die Weitergabe an Dritte sowie systematisches Downloaden sind untersagt.</subfield><subfield code="y">z</subfield><subfield code="z">01-02-23</subfield></datafield><datafield tag="980" ind1=" " ind2=" "><subfield code="2">110</subfield><subfield code="1">01</subfield><subfield code="x">3110</subfield><subfield code="b">4260663445</subfield><subfield code="h">OLR-DOAB</subfield><subfield code="k">Vervielfältigungen (z.B. Kopien, Downloads) sind nur von einzelnen Kapiteln oder Seiten und nur zum eigenen wissenschaftlichen Gebrauch erlaubt. Die Weitergabe an Dritte sowie systematisches Downloaden sind untersagt.</subfield><subfield code="k">Open Access</subfield><subfield code="y">z</subfield><subfield code="z">01-02-23</subfield></datafield><datafield tag="980" ind1=" " ind2=" "><subfield code="2">130</subfield><subfield code="1">01</subfield><subfield code="x">0700</subfield><subfield code="b">4260828495</subfield><subfield code="h">OLR-DOAB</subfield><subfield code="y">z</subfield><subfield code="z">01-02-23</subfield></datafield><datafield tag="980" ind1=" " ind2=" "><subfield code="2">131</subfield><subfield code="1">01</subfield><subfield code="x">3131</subfield><subfield code="b">4466989664</subfield><subfield code="h">OLR-OA-DOAB</subfield><subfield code="k">Bitte beachten Sie die Nutzungsbedingungen und Copyright-Bestimmungen des Verlages/Herausgebers.</subfield><subfield code="y">z</subfield><subfield code="z">24-01-24</subfield></datafield><datafield tag="980" ind1=" " ind2=" "><subfield code="2">132</subfield><subfield code="1">01</subfield><subfield code="x">0959</subfield><subfield code="b">4256276750</subfield><subfield code="h">OLR-OAB</subfield><subfield code="u">Open Access</subfield><subfield code="y">x</subfield><subfield code="z">31-01-23</subfield></datafield><datafield tag="980" ind1=" " ind2=" "><subfield code="2">136</subfield><subfield code="1">01</subfield><subfield code="x">3526</subfield><subfield code="b">4258180351</subfield><subfield code="h">OLR-DOAB</subfield><subfield code="y">z</subfield><subfield code="z">01-02-23</subfield></datafield><datafield tag="980" ind1=" " ind2=" "><subfield code="2">147</subfield><subfield code="1">01</subfield><subfield code="x">3528</subfield><subfield code="b">4261539950</subfield><subfield code="h">OLR-DOAB</subfield><subfield code="k">frei verfügbar für Europa-Universität Flensburg, Hochschule Flensburg und Zentrale Hochschulbibliothek</subfield><subfield code="k">Vervielfältigungen (z.B. 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Die Weitergabe an Dritte sowie systematisches Downloaden sind untersagt.</subfield><subfield code="y">z</subfield><subfield code="z">01-02-23</subfield></datafield><datafield tag="980" ind1=" " ind2=" "><subfield code="2">161</subfield><subfield code="1">01</subfield><subfield code="x">0960</subfield><subfield code="b">4255933553</subfield><subfield code="h">OLR-DOAB</subfield><subfield code="k">DOAB Directory of Open Access Books</subfield><subfield code="y">z</subfield><subfield code="z">31-01-23</subfield></datafield><datafield tag="980" ind1=" " ind2=" "><subfield code="2">213</subfield><subfield code="1">01</subfield><subfield code="x">0551</subfield><subfield code="b">4257591404</subfield><subfield code="h">OLR-DOAB</subfield><subfield code="k">DOAB Directory of Open Access Books</subfield><subfield code="y">z</subfield><subfield code="z">01-02-23</subfield></datafield><datafield tag="980" ind1=" " ind2=" "><subfield code="2">230</subfield><subfield code="1">01</subfield><subfield code="x">0552</subfield><subfield code="b">4257819278</subfield><subfield code="h">OLR-DOAB</subfield><subfield code="k">DOAB Directory of Open Access Books</subfield><subfield code="y">z</subfield><subfield code="z">01-02-23</subfield></datafield><datafield tag="980" ind1=" " ind2=" "><subfield code="2">283</subfield><subfield code="1">01</subfield><subfield code="x">3283</subfield><subfield code="b">4258514659</subfield><subfield code="k">Vervielfältigungen (z.B. 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Interacciones intermoleculares de la proteína de membrana Arf*GTP con potasio y glicerol, componentes mayoritarios de la vinaza de caña de azúcar |
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La vinaza de caña de azúcar, al ser un residuo producido en altas cantidades derivado de los procesos industriales para la producción de Etanol, es una mezcla de compuestos que tiene una utilidad cíclica para matrices de suelos debido a su composición natural e industrial que recaen en las ventajas y desventajas de sus aplicaciones. El potasio y el glicerol, compuestos mayoritarios en su composición, son ligandos que ayudan a la conformación de complejos proteicos con la vinaza para tener alternativas en los usos industriales como aditivos para alimento animal y fertilizantes en matrices de suelos, muchos de estos, utilizados en cultivos de las mismas industrias. Estudios de química computacional permiten conocer propiedades intermoleculares entre la vinaza, el glicerol y el potasio mediante in-eracciones moleculares estables convirtiéndola en una herramienta útil de evaluación de dichas propiedades y determinación de nuevas alternativas para usos industriales de este residuo. En esta investigación, se evaluó la dinámica de las interacciones intermoleculares entre el modelo proteínico tridimensional extraído del archivo de la base de datos de proteínas (PDB) por sus siglas en inglés, del modelo (2KSQ), el cual consiste en una proteína de membrana de la Echoli llamado Arf*GTP, con dos ligandos como potasio y glicerol mediante dinámica molecular utilizando un software llamado Dinámica Molecular Escalable por sus siglas en inglés, NAMD1. Se observaron y evaluaron las interacciones intermoleculares por medio del soft-ware llamado Visor de Dinámica Molecular por sus siglas en inglés, VMD2 de la molécula modelada de la proteína de membrana Arf*GTP con componentes mayoritarios, tales como, el potasio y el glicerol en un ambiente solvatado definido e implícito de modelo de caja de agua (TIP3) con el fin de identificar y caracterizar las fuerzas intermoleculares, equilibrio en trayectorias, fluctuaciones atómicas, afinidades, constantes de velocidad e interacciones Arf*GTP-Potasio, Arf*GTP-Glicerol y Arf*GTP-Potasio-Glicerol en el contexto de usos industriales de la vinaza como alimento animal y fertilizantes. Final-mente, se observó que los tres complejos Arf*GTP se ven favorecidos por afinidades posicionales de los ligandos como los aminoácidos GLN 155, para el caso del potasio, y para los gliceroles lo fueron GLY 27 y LYS 127, como también, apantallamientos de algunos átomos de los aminoácidos con los ligandos. Con esta investigación, se busca tener más información acerca de las interacciones intermoleculares y constantes de velocidad, equilibrio de trayectorias y afinidades químicas de la proteína de membrana Arf*GTP con otros ligandos orgánicos e inorgánicos que aporten nuevas alternativas industriales para el uso de la vinaza de caña de azúcar |
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La vinaza de caña de azúcar, al ser un residuo producido en altas cantidades derivado de los procesos industriales para la producción de Etanol, es una mezcla de compuestos que tiene una utilidad cíclica para matrices de suelos debido a su composición natural e industrial que recaen en las ventajas y desventajas de sus aplicaciones. El potasio y el glicerol, compuestos mayoritarios en su composición, son ligandos que ayudan a la conformación de complejos proteicos con la vinaza para tener alternativas en los usos industriales como aditivos para alimento animal y fertilizantes en matrices de suelos, muchos de estos, utilizados en cultivos de las mismas industrias. Estudios de química computacional permiten conocer propiedades intermoleculares entre la vinaza, el glicerol y el potasio mediante in-eracciones moleculares estables convirtiéndola en una herramienta útil de evaluación de dichas propiedades y determinación de nuevas alternativas para usos industriales de este residuo. En esta investigación, se evaluó la dinámica de las interacciones intermoleculares entre el modelo proteínico tridimensional extraído del archivo de la base de datos de proteínas (PDB) por sus siglas en inglés, del modelo (2KSQ), el cual consiste en una proteína de membrana de la Echoli llamado Arf*GTP, con dos ligandos como potasio y glicerol mediante dinámica molecular utilizando un software llamado Dinámica Molecular Escalable por sus siglas en inglés, NAMD1. Se observaron y evaluaron las interacciones intermoleculares por medio del soft-ware llamado Visor de Dinámica Molecular por sus siglas en inglés, VMD2 de la molécula modelada de la proteína de membrana Arf*GTP con componentes mayoritarios, tales como, el potasio y el glicerol en un ambiente solvatado definido e implícito de modelo de caja de agua (TIP3) con el fin de identificar y caracterizar las fuerzas intermoleculares, equilibrio en trayectorias, fluctuaciones atómicas, afinidades, constantes de velocidad e interacciones Arf*GTP-Potasio, Arf*GTP-Glicerol y Arf*GTP-Potasio-Glicerol en el contexto de usos industriales de la vinaza como alimento animal y fertilizantes. Final-mente, se observó que los tres complejos Arf*GTP se ven favorecidos por afinidades posicionales de los ligandos como los aminoácidos GLN 155, para el caso del potasio, y para los gliceroles lo fueron GLY 27 y LYS 127, como también, apantallamientos de algunos átomos de los aminoácidos con los ligandos. Con esta investigación, se busca tener más información acerca de las interacciones intermoleculares y constantes de velocidad, equilibrio de trayectorias y afinidades químicas de la proteína de membrana Arf*GTP con otros ligandos orgánicos e inorgánicos que aporten nuevas alternativas industriales para el uso de la vinaza de caña de azúcar |
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La vinaza de caña de azúcar, al ser un residuo producido en altas cantidades derivado de los procesos industriales para la producción de Etanol, es una mezcla de compuestos que tiene una utilidad cíclica para matrices de suelos debido a su composición natural e industrial que recaen en las ventajas y desventajas de sus aplicaciones. El potasio y el glicerol, compuestos mayoritarios en su composición, son ligandos que ayudan a la conformación de complejos proteicos con la vinaza para tener alternativas en los usos industriales como aditivos para alimento animal y fertilizantes en matrices de suelos, muchos de estos, utilizados en cultivos de las mismas industrias. Estudios de química computacional permiten conocer propiedades intermoleculares entre la vinaza, el glicerol y el potasio mediante in-eracciones moleculares estables convirtiéndola en una herramienta útil de evaluación de dichas propiedades y determinación de nuevas alternativas para usos industriales de este residuo. En esta investigación, se evaluó la dinámica de las interacciones intermoleculares entre el modelo proteínico tridimensional extraído del archivo de la base de datos de proteínas (PDB) por sus siglas en inglés, del modelo (2KSQ), el cual consiste en una proteína de membrana de la Echoli llamado Arf*GTP, con dos ligandos como potasio y glicerol mediante dinámica molecular utilizando un software llamado Dinámica Molecular Escalable por sus siglas en inglés, NAMD1. Se observaron y evaluaron las interacciones intermoleculares por medio del soft-ware llamado Visor de Dinámica Molecular por sus siglas en inglés, VMD2 de la molécula modelada de la proteína de membrana Arf*GTP con componentes mayoritarios, tales como, el potasio y el glicerol en un ambiente solvatado definido e implícito de modelo de caja de agua (TIP3) con el fin de identificar y caracterizar las fuerzas intermoleculares, equilibrio en trayectorias, fluctuaciones atómicas, afinidades, constantes de velocidad e interacciones Arf*GTP-Potasio, Arf*GTP-Glicerol y Arf*GTP-Potasio-Glicerol en el contexto de usos industriales de la vinaza como alimento animal y fertilizantes. Final-mente, se observó que los tres complejos Arf*GTP se ven favorecidos por afinidades posicionales de los ligandos como los aminoácidos GLN 155, para el caso del potasio, y para los gliceroles lo fueron GLY 27 y LYS 127, como también, apantallamientos de algunos átomos de los aminoácidos con los ligandos. Con esta investigación, se busca tener más información acerca de las interacciones intermoleculares y constantes de velocidad, equilibrio de trayectorias y afinidades químicas de la proteína de membrana Arf*GTP con otros ligandos orgánicos e inorgánicos que aporten nuevas alternativas industriales para el uso de la vinaza de caña de azúcar |
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El potasio y el glicerol, compuestos mayoritarios en su composición, son ligandos que ayudan a la conformación de complejos proteicos con la vinaza para tener alternativas en los usos industriales como aditivos para alimento animal y fertilizantes en matrices de suelos, muchos de estos, utilizados en cultivos de las mismas industrias. Estudios de química computacional permiten conocer propiedades intermoleculares entre la vinaza, el glicerol y el potasio mediante in-eracciones moleculares estables convirtiéndola en una herramienta útil de evaluación de dichas propiedades y determinación de nuevas alternativas para usos industriales de este residuo. En esta investigación, se evaluó la dinámica de las interacciones intermoleculares entre el modelo proteínico tridimensional extraído del archivo de la base de datos de proteínas (PDB) por sus siglas en inglés, del modelo (2KSQ), el cual consiste en una proteína de membrana de la Echoli llamado Arf*GTP, con dos ligandos como potasio y glicerol mediante dinámica molecular utilizando un software llamado Dinámica Molecular Escalable por sus siglas en inglés, NAMD1. Se observaron y evaluaron las interacciones intermoleculares por medio del soft-ware llamado Visor de Dinámica Molecular por sus siglas en inglés, VMD2 de la molécula modelada de la proteína de membrana Arf*GTP con componentes mayoritarios, tales como, el potasio y el glicerol en un ambiente solvatado definido e implícito de modelo de caja de agua (TIP3) con el fin de identificar y caracterizar las fuerzas intermoleculares, equilibrio en trayectorias, fluctuaciones atómicas, afinidades, constantes de velocidad e interacciones Arf*GTP-Potasio, Arf*GTP-Glicerol y Arf*GTP-Potasio-Glicerol en el contexto de usos industriales de la vinaza como alimento animal y fertilizantes. Final-mente, se observó que los tres complejos Arf*GTP se ven favorecidos por afinidades posicionales de los ligandos como los aminoácidos GLN 155, para el caso del potasio, y para los gliceroles lo fueron GLY 27 y LYS 127, como también, apantallamientos de algunos átomos de los aminoácidos con los ligandos. Con esta investigación, se busca tener más información acerca de las interacciones intermoleculares y constantes de velocidad, equilibrio de trayectorias y afinidades químicas de la proteína de membrana Arf*GTP con otros ligandos orgánicos e inorgánicos que aporten nuevas alternativas industriales para el uso de la vinaza de caña de azúcar</subfield></datafield><datafield tag="540" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">Creative Commons</subfield><subfield code="f">https://creativecommons.org/licenses/by/4.0</subfield><subfield code="2">cc</subfield></datafield><datafield tag="546" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">Spanish</subfield></datafield><datafield tag="650" ind1=" " ind2="4"><subfield code="a">Pollution control</subfield></datafield><datafield tag="700" ind1="1" ind2=" "><subfield code="a">Bonilla Millán, Fernando</subfield><subfield code="e">verfasserin</subfield><subfield code="4">aut</subfield></datafield><datafield tag="700" ind1="1" ind2=" "><subfield code="a">Rodríguez Estrada, Jhon Alexander</subfield><subfield code="e">verfasserin</subfield><subfield code="4">aut</subfield></datafield><datafield tag="700" ind1="1" ind2=" "><subfield code="a">Rojas Álvarez, Oscar Eduardo</subfield><subfield code="e">herausgeberin</subfield><subfield code="4">edt</subfield></datafield><datafield tag="856" ind1="4" ind2="0"><subfield code="u">https://directory.doabooks.org/handle/20.500.12854/83941.2</subfield><subfield code="m">X:DOAB</subfield><subfield code="x">Verlag</subfield><subfield code="z">kostenfrei</subfield></datafield><datafield tag="912" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">ZDB-94-OAB</subfield></datafield><datafield tag="912" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">GBV_ILN_11</subfield></datafield><datafield tag="912" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">ISIL_DE-1a</subfield></datafield><datafield tag="912" ind1=" " ind2=" "><subfield code="a">SYSFLAG_1</subfield></datafield><datafield tag="912" ind1=" " ind2=" "><subfield 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