AluMine: alignment-free method for the discovery of polymorphic Alu element insertions

Abstract Background Recently, alignment-free sequence analysis methods have gained popularity in the field of personal genomics. These methods are based on counting frequencies of short k-mer sequences, thus allowing faster and more robust analysis compared to traditional alignment-based methods. Re...
Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Autor*in:

Tarmo Puurand [verfasserIn]

Viktoria Kukuškina [verfasserIn]

Fanny-Dhelia Pajuste [verfasserIn]

Maido Remm [verfasserIn]

Format:

E-Artikel

Sprache:

Englisch

Erschienen:

2019

Schlagwörter:

Alu repeat element

Mobile element insertions

Alignment-free sequence analysis

Übergeordnetes Werk:

In: Mobile DNA - BMC, 2010, 10(2019), 1, Seite 13

Übergeordnetes Werk:

volume:10 ; year:2019 ; number:1 ; pages:13

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Journal toc

DOI / URN:

10.1186/s13100-019-0174-3

Katalog-ID:

DOAJ001295322

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