SparkGC: Spark based genome compression for large collections of genomes

Abstract Since the completion of the Human Genome Project at the turn of the century, there has been an unprecedented proliferation of sequencing data. One of the consequences is that it becomes extremely difficult to store, backup, and migrate enormous amount of genomic datasets, not to mention the...
Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Autor*in:

Haichang Yao [verfasserIn]

Guangyong Hu [verfasserIn]

Shangdong Liu [verfasserIn]

Houzhi Fang [verfasserIn]

Yimu Ji [verfasserIn]

Format:

E-Artikel

Sprache:

Englisch

Erschienen:

2022

Schlagwörter:

Genome compression

Reference-based compression

Spark

Distributed parallel

Übergeordnetes Werk:

In: BMC Bioinformatics - BMC, 2003, 23(2022), 1, Seite 21

Übergeordnetes Werk:

volume:23 ; year:2022 ; number:1 ; pages:21

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Journal toc

DOI / URN:

10.1186/s12859-022-04825-5

Katalog-ID:

DOAJ035621281

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