Comprehensive Genome Analysis of 6,000 USA SARS-CoV-2 Isolates Reveals Haplotype Signatures and Localized Transmission Patterns by State and by Country

Genomic analysis of SARS-CoV-2 sequences is crucial in determining the effectiveness of prudent safer at home measures in the United States (US). By haplotype analysis of 6,356 US isolates, we identified a pattern of strongly localized outbreaks at the city-, state-, and country-levels, and temporal...
Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Autor*in:

Lishuang Shen [verfasserIn]

Jennifer Dien Bard [verfasserIn]

Jaclyn A. Biegel [verfasserIn]

Alexander R. Judkins [verfasserIn]

Xiaowu Gai [verfasserIn]

Format:

E-Artikel

Sprache:

Englisch

Erschienen:

2020

Schlagwörter:

COVID-19

SARS-CoV-2

haplotype

variant

localized outbreak

temporal transmission

Übergeordnetes Werk:

In: Frontiers in Microbiology - Frontiers Media S.A., 2011, 11(2020)

Übergeordnetes Werk:

volume:11 ; year:2020

Links:

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Journal toc

DOI / URN:

10.3389/fmicb.2020.573430

Katalog-ID:

DOAJ043802249

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