T4SEpp: A pipeline integrating protein language models to predict bacterial type IV secreted effectors

Many pathogenic bacteria use type IV secretion systems (T4SSs) to deliver effectors (T4SEs) into the cytoplasm of eukaryotic cells, causing diseases. The identification of effectors is a crucial step in understanding the mechanisms of bacterial pathogenicity, but this remains a major challenge. In t...
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Autor*in:

Yueming Hu [verfasserIn]

Yejun Wang [verfasserIn]

Xiaotian Hu [verfasserIn]

Haoyu Chao [verfasserIn]

Sida Li [verfasserIn]

Qinyang Ni [verfasserIn]

Yanyan Zhu [verfasserIn]

Yixue Hu [verfasserIn]

Ziyi Zhao [verfasserIn]

Ming Chen [verfasserIn]

Format:

E-Artikel

Sprache:

Englisch

Erschienen:

2024

Schlagwörter:

T4SEpp

T4SE Prediction

T4SS

Deep learning

Protein language model

Helicobacter pylori T4SEs

Übergeordnetes Werk:

In: Computational and Structural Biotechnology Journal - Elsevier, 2013, 23(2024), Seite 801-812

Übergeordnetes Werk:

volume:23 ; year:2024 ; pages:801-812

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Journal toc

DOI / URN:

10.1016/j.csbj.2024.01.015

Katalog-ID:

DOAJ095908463

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